Проектирование пассажирской станции в Петербурге было начато в 1843 году. Отсюда в середине ХIХ столетия протянулась до Москвы первая в России, крупнейшая в то время в Европе, двухпутная магистральная Петербурго -Московская железная дорога.
Первый пассажирский поезд из Вологды отправился в 1872 году, а первый деревянный вокзал дожил до наших дней, не утратив первоначального облика. Нынешний вокзал построили в 1897 году.
Железнодорожная станция Ялуторовск, расположенная на Транссибирской магистрали, была открыта в 1912 году и стала важным транспортным узлом. Вокзал создает историческую атмосферу провинциального сибирского города и располагает всем необходимым для комфортного путешествия.